十三幫會館位于禹州城區(qū)西北隅，居山西會館南側(cè)、懷幫會館西側(cè)。清同治十年（1871年），會首郭廣德、連文中、潘升炎、阮耀祥、王凌云、常天福、高有幫、蔡漢文、胡乾之、王二元、范廷棟等，捐錢創(chuàng)修十三幫院墻及關(guān)帝廟。清同治十二年（1873年）六月，藥行幫、藥棚幫、甘草幫、黨參幫、茯苓幫、江西幫、懷慶幫、祁州幫、陜西幫、四川幫、老河口幫、漢口幫、寧波幫等十三個藥幫，集資購地1.33公頃（20畝），共建“十三幫會館”。清光緒二十年（1894年），會首徐長聚、武清、耿金鏞集資創(chuàng)修十三幫藥王殿、演戲樓。清光緒二十六年（1900年），十三幫會館廚房、養(yǎng)病院、陰宅院、道院、二門、影壁墻建成。清光緒二十九年（1903年），十三幫又建會議所一處。
在布局上，十三幫會館分廟院、中配院、會議所三部分。其中，廟院位于會館西側(cè)，由九龍壁、鐵木旗桿、山門、鐘樓和鼓樓、戲樓、東西廊房、拜臺、拜殿、大殿和配殿組成。整體建筑坐北向南，前低后高，布局嚴(yán)謹(jǐn)。山門外，南圍墻與九龍壁結(jié)為一體，墻內(nèi)為東西向磚鋪甬道，東端為臨街大門。九龍壁由彩釉方磚拼砌而成，底部為巨大的方形青石雕座，群龍盤繞，栩栩如生。山門外有一對雌雄石獅分立兩側(cè)，山門兩端為八角騰空、兩層起架的鐘樓和鼓樓。戲樓下部居中軸線有一拱券過洞，可直通后大殿，兩側(cè)筑有高墻，各有高大磚拱圓形券門。廟院鋪滿紅方石，居中一株國槐枝葉茂盛，遮天蔽日。東西廂房門前栽培名貴月季，房后古柏參天。
沿中軸線后行至拜臺，拜臺為雙側(cè)臺階，中嵌石雕，臺面三丈見方，東、南、西三邊以石欄相圍，石欄間立方柱，柱頂有猴、桃等精美雕刻。越過拜臺是拜殿和大殿，大殿為木結(jié)構(gòu)建筑，單檐斗拱，以彩釉琉璃瓦蓋頂，五脊有琉璃彩磚盤龍飛鳳、獸頭、人物等藝術(shù)裝飾，四隅挑角，玲瓏別致，巍峨壯觀。中配院迎九龍壁為琉璃瓦頂、五脊六獸的轅門，進門沿中軸線鋪有青磚甬道。整個中配院為一四合院，其中北上房為青磚琉璃瓦、明三暗五的大客廳，可作為迎賓謀事之地。東跨院為會議所，是接待賓客及聚餐之地。
十三幫會館歷經(jīng)滄桑，主要建筑九龍壁、鐵木旗桿、山門、鐘鼓樓已蕩然無存，直至2000年，尚遺有十三幫創(chuàng)始碑記一通、界石一塊、扇形及長方形石額各兩塊。其中扇形石額一刻“賞花”，一刻“酌酒”；長方形石額一刻“光緒癸卯十三幫會館闔社仝立”，一刻“光緒丁未會議所藥商仝立”。界石上款為“墻基余地五尺寬”，正文為“藥幫會館西墻地界”，落款為“同治拾貳年六月修建”。碑記全文曰：“闔社公議，不許將廟中房屋借與外人使用，倘有本幫人私借與外人者，罰酒席十桌”，落款為“光緒二十九年立”。
民國初年，軍閥混戰(zhàn)，會館成為軍閥部隊的常年駐地。1922年，陜軍曹世英一部占據(jù)十三幫會館為司令部，曾與紅槍會在會館周圍展開激戰(zhàn)。1926年至1930年，十三幫會館相繼被李鎮(zhèn)亞、王老五、劉黑七等土匪、軍閥長期盤踞。1932年，十三幫會館被設(shè)為刑場。1936年至1947年，十三幫會館又被改建為私立東山中學(xué)。1947年冬，解放軍中原軍區(qū)司令部由寶豐遷至禹縣，劉伯承、鄧小平等曾在十三幫會館辦公。