孔氏南宗家廟位于衢州市區(qū)新橋街中段北側(cè)，占地面積14000平方米，建筑面積7490平方米。家廟東軸線、中軸線建於清道光年間，后經(jīng)修繕；市政府出資1600萬(wàn)元于1998年11月開始復(fù)建的家廟西軸線與孔府、孔園，2000年5月竣工，2000年7月1日正式對(duì)外開放。
一、家廟主要建筑：
東軸線：正門、恩官祠、啟圣祠、圣澤樓。
中軸線：正門(孔氏南宗家廟)、大成門、東西兩廡、大成殿。
西軸線：正門(孔府先宗)、五支祠、襲封祠、六代公爵祠、思魯閣。
孔府：照壁、正門(東南闕里)、大堂、花廳、內(nèi)宅，西側(cè)為長(zhǎng)廊及臨街廂房。
孔園：以大中堂為中心的園林，其間有亭、臺(tái)、閣、榭、假山、回廊和池塘。
二、沿革：自南宋建衢州孔氏家廟至建國(guó)前夕，一直由孔子世代嫡長(zhǎng)孫掌管“衍圣公府”、“博士署”和“奉禮官府”。解放后由政府委托文化部門管理。1999年，市政府直屬機(jī)構(gòu)孔氏南宗家廟管理委員會(huì)全權(quán)管理家廟及孔府事宜。
三、歷史上的孔氏南宗家廟及孔氏南宗府：建炎三年(1129年)，孔子四十八世嫡長(zhǎng)孫、衍圣公孔端友扈蹕南渡。建炎中，宋高宗下詔“權(quán)以州學(xué)為廟”。至宋理宗寶祐元年(1253年)仲夏，北歸無(wú)望，衍圣公孔洙及衢州郡守孫子秀奏請(qǐng)新建家廟，朝廷撥款三十六萬(wàn)緡，建家廟於城東北菱湖之上，建筑規(guī)模達(dá)二百余楹，規(guī)制與曲阜家廟同。次年仲春落成。宋末元初，家廟毀於兵，遷於城南。但“其制非寶祐之舊”。
至元十九年(1283年)，經(jīng)廷議，認(rèn)定孔氏南宗為孔圣人之宗子，元始祖乃召孔子五十三世嫡長(zhǎng)孫、衍圣公孔洙赴京，令其載爵返曲阜奉祀祖廟奉祀；孔洙以廟墓在衢為由，讓爵於曲阜，元始祖贊其“寧為榮而不違道，真圣人后也”，改任其國(guó)子監(jiān)祭酒歸守江南廟祀。從此，孔氏大宗失爵。
明弘治十八年(1505年)，衢州知府沈杰向明孝宗朱祐樘上疏，稱：“衢州圣廟，自孔洙讓爵之后，衣冠禮儀，猥同氓庶。今訪得洙六世孫孔彥繩，請(qǐng)授于官，俾主祭事?！贝文?，即正德元年(1506年)，接位的武宗朱厚照秉承先皇旨意，封孔彥繩為翰林院五經(jīng)博士，子孫世襲。這樣，衢州孔氏大宗在失去爵位224年之后，又得到了封號(hào)。1935年，國(guó)民政府廢去一切封建爵位，分別改任孔子七十三世嫡長(zhǎng)孫孔繁豪為和孔子七十七世孫孔德成為南宗、北宗“大成至圣先師奉祀官”。
關(guān)于孔氏南宗，孔德成先生1937年在《孔子世家譜序》中寫道：“……魯之宗親，僅四十三代祖溫如公以藐孤存焉，是為孔氏中興祖。后五傳而至端友公，以從宋南渡家於衢，是謂南宗。”
自清之后，孔氏南宗家廟再未易址。但順治、康熙、雍正、乾隆、道光、同治、光緒歷朝累有修葺，其中以道光元年的修建規(guī)模最大，主要工程有：移思魯閣於大成殿西北隅、大成殿殿基增高五尺、楹柱易木為石、崇圣祠(即啟圣祠)以下皆拓而新之。整個(gè)工程歷時(shí)近一年半，耗資萬(wàn)余金，家廟為之一新。
抗戰(zhàn)時(shí)期，日軍二次占領(lǐng)衢州，樂(lè)器、禮器被擄略一空。1947年，國(guó)民政府曾撥款維修。1960年衢縣縣政府曾撥款維修。1984年，衢州市政府撥款對(duì)家廟的主體建筑進(jìn)行維修。1988年，衢州市政府再次撥款對(duì)家廟進(jìn)行維修，并復(fù)建圣澤樓和修葺思魯閣。1989年12月12日，浙江省人民政府公布孔氏南宗家廟為省級(jí)文保單位。1996年11月20日，國(guó)務(wù)院批準(zhǔn)孔氏南宗家廟為全國(guó)重點(diǎn)文物保護(hù)單位。2000年5月，衢州市人民政府主持復(fù)建的家廟西軸線與孔府竣工。
四、主要文物遺存：子貢手摹孔子夫婦楷木像、吳道子畫孔子佩劍像、石碑等。