石墩巡檢司城遺址位于浙江省嘉興海寧市黃灣鎮(zhèn)（尖山新區(qū)）大臨村東南俞家場(chǎng)，南鄰老滬杭公路，始建于明洪武二十年（1387），原為石墩巡檢司駐地，清乾隆五年（1740）后為尖山汛把總（后改千總）駐地。
城址呈四方形，周長(zhǎng)240丈（約799.2米），高一丈八尺（約5.99米），寬一丈（約3.33米），四周設(shè)護(hù)城河，東西設(shè)城門(mén)及吊橋。磚石城墻于清同治三年（1864）在清軍與太平軍的激戰(zhàn)中遭毀，今僅存隆起的土坡。
該遺址是浙江省內(nèi)現(xiàn)存為數(shù)不多的明代巡檢司級(jí)的海防軍事建筑，是研究明代巡檢司城防構(gòu)造的重要對(duì)象，也是研究浙江抗倭斗爭(zhēng)史的重要實(shí)物例證。
2017年1月13日，被公布為第七批浙江省文物保護(hù)單位。