萬安千戶所城城墻用花崗巖方石構(gòu)筑，其周長1773米，高5.30米，上有女墻827個、警鋪13座、敵樓18座、開東、西、南三城門，上皆建城樓。城三面環(huán)海，小而險固，西門城下港口可泊船艦。現(xiàn)僅存三段殘墻，一處城門的門座，一處炮臺。
城內(nèi)依山勢鋪設(shè)的石板街道南北逶迤。因其地勢西南狹小、東北闊大，形如葫蘆，故舊稱“葫蘆城”。據(jù)志載，當年石板街道兩旁屋舍儼然，櫛比鱗次，人丁興旺，住戶逾千。城內(nèi)有祝圣寺、關(guān)圣殿和天后宮、文昌祠、觀音閣、海潮庵等寺院，現(xiàn)寺殿多已不存，僅祝圣寶塔經(jīng)歷兵災劫難和風雨剝蝕尚存。
烽火臺為覆斗形結(jié)構(gòu)，用塊石壘筑而成，頂部呈長方形造型，烽火臺的煙墩高為5.0米，底座各邊長約12米，頂部開口各邊長約8米。頂部用于點火的灶坑長2.30米，寬0.65米，深0.50米。烽火臺的煙墩只有東西側(cè)石塊塌陷一小部分，其他主體包括旁邊的灶坑都保存完好，就連依附煙墩旁的營房和草料房還留有部分墻體。
據(jù)《八閩通志》及清乾隆《福清縣志》記載：明洪武二十年（西元1387年），萬安古城由江夏侯周德興調(diào)集福、興、漳、泉四府匠役，費時10年修成。葉向高曾論曰：“鎮(zhèn)東堅而實，萬安小而險，故難破也”。
清涂之堯在《故鄉(xiāng)風物記》中說：“萬安城既以海為地，以山為郭，故劉香、鄭芝龍盛時，連檣數(shù)萬，兵甲曜日，屢攻萬安不能一克”
清順治十八年（西元1661年）9月，清庭“遷海”，城內(nèi)居民全被內(nèi)遷，萬安古城成為空城。
清代，萬安古城因海防位置重要，設(shè)旗軍多達千余名。
1981年2月25日，萬安古城殘墻列為福清縣第一批重點文物保護單位。