公元1181～1189年間，止貢巴·仁欽貝造其弟子巴登向秋能巴由西藏止貢替寺赴八邦傳演止貢噶舉教義，并主持修建了八邦寺的前身一二兄里寺大殿上座，在太殿鄰近的兩個(gè)山頭分別建起“著郎干”講學(xué)院和“五且”坐經(jīng)院。寺廟舉行法會(huì)，則集合僧侶在曲池西（今鄉(xiāng)政府駐地）講經(jīng)授法。16世紀(jì)中葉，兄里寺被一名叫“阿熱”的炊事僧人失火焚毀。清初，從西藏阿里云游至德格的薩迦高僧赤稱俄熱看中了八邦“三象戲水”的奇麗地形，在荒蕪的兄里寺原址建起一薩迦寺廟，但因規(guī)模不大，僧侶不多未獲發(fā)展。
清雍正六年（1728），出生于德格龔埡阿洛定日崗的噶舉名僧，被嘎瑪?shù)谑?蓋西多吉認(rèn)定為昌都嘎瑪寺第八世司徒-的司徒·曲吉龔勒于28歲時(shí)征得土司登巴澤仁允準(zhǔn)，以龔埡班黨寺為母寺，在原兄里寺地址親自主持修建起噶瑪噶舉派的八邦寺；并在法王登巴澤仁的挽留下?lián)瘟税税钏轮鞒?，被尊稱為八邦寺第一代司徒-。此后，歷代轉(zhuǎn)世的司徒-均任八邦寺主持，不再任昌都嘎瑪寺主持。
八邦寺建成后礦在政教上都獲較大發(fā)展。寺廟自稱“國(guó)師廟”，以元代所封國(guó)師噶瑪拔希（德格汪布頂人）曾任兄里寺主持，歷代供奉元憲宗賜與噶瑪拔希的金邊黑帽?！杜f西康省康屬概況》記，第八世司徒曾得授朝廷“四寶法王”稱號(hào)并劃撥德格土司人民，土地一半與八邦寺。乾隆年間，乾隆皇帝親筆書寫“祈禱番根大益司徒”橫匾賜予寺廟并兩次詔請(qǐng)第八世司徒·曲吉龔勒赴京講經(jīng)民國(guó)時(shí)颯，-政府亦十分重視八邦寺在藏區(qū)的政教影響。1938年，劉文輝聘任司徒-為“五明學(xué)院”的康北宣教師，德格縣政府則安置司徒為縣參議會(huì)副參議長(zhǎng)。1940年，八邦寺清真一行8人應(yīng)邀赴重慶參加“抗戰(zhàn)勝利祈禱法會(huì)"，蔣介石厚贈(zèng)禮品并與清真等一行合影留念。八邦寺為德格土司第一家廟，在維護(hù)和鞏固政教合一的土司統(tǒng)治中有舉足輕重的位置。寺廟享有較高的政治特權(quán)，司徒-有權(quán)參加德格土司最高行政會(huì)議，土司轄區(qū)有關(guān)政治、經(jīng)濟(jì)、軍事、文化等重大活動(dòng)，制訂重大政令，大小頭人的升遷，以至土司嗣位大事，德格土司均要征得司徒的意見(jiàn)并認(rèn)可。同時(shí)，德格土司又以法王的身份號(hào)令八邦寺。近百年來(lái)，八邦寺苘僧云集，宗教人才輩出。許多-、-均為研習(xí)“五明學(xué)”多有建樹(shù)的著名學(xué)者，留下不少內(nèi)容從佛學(xué)到天文學(xué)、詩(shī)明學(xué)、文學(xué)、醫(yī)藥學(xué)、文法、歷史、繪畫等學(xué)科的著述。如第八世司徒·曲吉龔勒的《印度旅行記》t《詩(shī)學(xué)的解釋與參考》、《司徒文法廣釋》、《如意藤標(biāo)簽》、《自傳圖名術(shù)》，尼麥曲杰翁波的《捉鬼記》、《花園里蜜蜂的遭遇》，貢珠·顏登降錯(cuò)的《知識(shí)總匯》、白馬德西翁波的《自傳全集》，以及八邦寺近現(xiàn)代名僧降央部杰嘉措、降根洛珠塔顏、斯郎熱登戈日降巴、白馬根絨、巴登青則俄色等人的著述均為涉及學(xué)科廣，頗有造詣和具有很大影響的優(yōu)秀作品。
八邦寺分母寺、于寺（分寺）兩部分，母寺有大、小經(jīng)堂各1座，設(shè)講經(jīng)院1所，設(shè)納若、根仁、黨母3所坐經(jīng)院。子寺有100多座，主要分布在青海、云南和四川甘孜州地區(qū)。寺廟設(shè)司徒、貢珠、清真、溫根4個(gè)-轉(zhuǎn)世系統(tǒng)。解放初統(tǒng)計(jì)，全寺有僧侶725人，其中-4人，外地留學(xué)-2人，堪布5人，職事-18人，一般-83人，扎巴613人；有森林、牧場(chǎng)近4000平方公里，有耕地2000余畝，牲畜4·3萬(wàn)頭（只），科巴（農(nóng)牧）1000多戶，從事大宗的商業(yè)和0經(jīng)營(yíng)；寺廟文物有大型鍍金泥塑佛像7座，各類紅黃銅菩薩9835尊，各個(gè)歷史時(shí)期唐嘎畫10150幅，經(jīng)典32400部，木刻印版129845張，純金譽(yù)寫的? ??甘珠爾》1套，其它佛具和各個(gè)歷史時(shí)期的詔書、印章等近5000件。
解放后，廢除了八邦寺的政治和經(jīng)濟(jì)特權(quán)?！拔母铩逼陂g，“造反派”開(kāi)展“破四舊”活動(dòng)，寺廟部分房屋被占用，寺廟財(cái)產(chǎn)、文物受到很大損失。1981年以后，寺廟建起16人組成的寺廟管理委員會(huì)，籌集資金修復(fù)了寺廟，逐漸發(fā)展寺廟自養(yǎng)經(jīng)濟(jì)。1988年，寺廟大殿維修竣工，新塑高15米、寬5米的彌勒佛銅殼塑像1尊，建起佛學(xué)院1所，恢復(fù)了"納若"和"根仁"2座坐經(jīng)院。全寺有僧侶375人，其中-4人（尚在印度），堪布3人。寺廟自養(yǎng)經(jīng)濟(jì)主要開(kāi)展采藥制藥、商業(yè)、雕塑、繪畫、建筑、養(yǎng)畜、印售經(jīng)書等活動(dòng)，年收入5萬(wàn)余元。
保護(hù)范圍：東至“通天梯”及“坐來(lái)直普”靠巖石處，南至水磨房刻瑪尼石房，西至“多泉房”及“屠宰溝”，北至“頂領(lǐng)圣佛”草坪
建設(shè)控制地帶：在保護(hù)范圍的基礎(chǔ)上向南延伸5米，向北延伸7米。